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Um blog sobre ciência focado em biologia, evolução e pitadas de humor
Atila
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- July 19, 2011
- 06:44 AM
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Vírus espalhando resistência a antibióticos no ambiente
by Atila in Rainha Vermelha
Bactérias resistentes a antibióticos são um problema recente e crescente, principalmente em ambientes hospitalares. Originalmente, os genes que ajudam a degradar antibióticos e geram a tolerância estavam presentes nos microorganismos que produzem as moléculas que isolamos e utilizamos como remédios. Para contribuir com a resistência em bactérias de importância médica, estes genes precisam de alguma forma circular até elas.Um dos mecanismos mais conhecidos para transmissão gen........ Read more »
Colomer-Lluch, M., Jofre, J., & Muniesa, M. (2011) Antibiotic Resistance Genes in the Bacteriophage DNA Fraction of Environmental Samples. PLoS ONE, 6(3). DOI: 10.1371/journal.pone.0017549
- March 14, 2011
- 06:11 AM
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Como respirar em altitude, um guia prático. Autor: Evolução
by Atila in Rainha Vermelha
Edmund Hillary Tenzing Norgay (sherpa), as primeiras pessoas a atingirem o topo do monte Everest. Fonte: Wikimedia Um mesmo problema encontrado pelas pessoas que vivem em locais de grande altitude: a falta de oxigênio. Já a solução, as adaptações evolutivas que contornam a falta de oxigênio são bastante diferentes entre as populações andinas e tibetanas. Um bom exemplo de como a seleção natural pode favorecer diferentes respostas para um mesmo problema. Qu........ Read more »
Yi, X., Liang, Y., Huerta-Sanchez, E., Jin, X., Cuo, Z., Pool, J., Xu, X., Jiang, H., Vinckenbosch, N., Korneliussen, T.... (2010) Sequencing of 50 Human Exomes Reveals Adaptation to High Altitude. Science, 329(5987), 75-78. DOI: 10.1126/science.1190371
Beall, C. (2007) Colloquium Papers: Two routes to functional adaptation: Tibetan and Andean high-altitude natives. Proceedings of the National Academy of Sciences, 104(suppl_1), 8655-8660. DOI: 10.1073/pnas.0701985104
- December 20, 2010
- 05:21 AM
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A cura para o HIV! Pero no mucho...
by Atila in Rainha Vermelha
Fonte.Estamos em uma época onde o HIV já não é mais uma sentença de morte. Com o uso de uma série de antivirais ao mesmo tempo -- terapia chamada de HAART, highly active antiretroviral therapy -- e com o tratamento de possíveis doenças oportunistas, hoje é possível para o HIV positivo conviver com níveis indetectáveis do vírus durante anos. Já existem portadores tratados por mais de 20 anos. O que não quer dizer que estejam curados.Os antivirais são drogas caras e causam vário........ Read more »
Richman, D., Margolis, D., Delaney, M., Greene, W., Hazuda, D., & Pomerantz, R. (2009) The Challenge of Finding a Cure for HIV Infection. Science, 323(5919), 1304-1307. DOI: 10.1126/science.1165706
Samson, M., Libert, F., Doranz, B., Rucker, J., Liesnard, C., Farber, C., Saragosti, S., Lapouméroulie, C., Cognaux, J., Forceille, C.... (1996) Resistance to HIV-1 infection in Caucasian individuals bearing mutant alleles of the CCR-5 chemokine receptor gene. Nature, 382(6593), 722-725. DOI: 10.1038/382722a0
- November 17, 2010
- 09:56 AM
- 321 views
Por que ocorre a dengue hemorrágica
by Atila in Rainha Vermelha
fonte: WikimediaApesar de ter apenas um nome, dengue, esta doença é causada por quatro sorotipos diferentes do vírus da dengue. No Brasil, circulam os sorotipos 1, 2 e 3. Cada sorotipo varia geneticamente entre 30 e 35% em relação aos outros, suficiente para que a imunidade gerada contra um deles não proteja contra os demais. Um paciente infectado pelo sorotipo 1 não está protegido da infecção pelo sorotipo 2, por exemplo. E justamente nesta infecção secundária ocorre a maior parte ........ Read more »
Dejnirattisai, W., Jumnainsong, A., Onsirisakul, N., Fitton, P., Vasanawathana, S., Limpitikul, W., Puttikhunt, C., Edwards, C., Duangchinda, T., Supasa, S.... (2010) Cross-Reacting Antibodies Enhance Dengue Virus Infection in Humans. Science, 328(5979), 745-748. DOI: 10.1126/science.1185181
- November 14, 2010
- 10:39 PM
- 404 views
Para o HIV, o meio também é a mensagem
by Atila in Rainha Vermelha
Imagine que você tem um recado que precisa ser lido de qualquer forma pelo seu alvo, e levado ao pé da letra. E para piorar, o número de letras que pode usar é super restrito. Como transmitir mais informação do que o recado em si?
Estrutura do genoma do HIV ©Nature 2009, referência ao finalEste é o desafio que o HIV encontra. Para dominar o metabolismo da célula e comandar a produção de mais vírus, ele precisa produzir uma grande molécula de RNa que será lida pelo ribossomo ........ Read more »
Watts, J., Dang, K., Gorelick, R., Leonard, C., Bess Jr, J., Swanstrom, R., Burch, C., & Weeks, K. (2009) Architecture and secondary structure of an entire HIV-1 RNA genome. Nature, 460(7256), 711-716. DOI: 10.1038/nature08237
- September 22, 2010
- 05:54 AM
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Vaccinia em mamíferos silvestres: um caso de "humanose"
by Atila in Rainha Vermelha
Estamos acostumados a nos preocupar com doenças que podem saltar de outros animais para humanos, como SARS, Ebola e gripe aviária, as zoonoses. Mas quem disse que o único caminho é um vírus saltar para humanos? Por que não mandamos doenças de volta?fonte: WikimediaO vírus da vaccinia é nosso "companheiro" de longa data. Ele foi o vírus isolado de vacas por Edward Jenner em 1976 para fazer a vacinação contra seu "primo", o vírus da varíola, um dos primeiros passos para o desenv........ Read more »
Abrahao, J. (2010) Vaccinia Virus Infection in Monkeys, Brazilian Amazon. Emerging Infectious Diseases. DOI: 10.3201/eid1606.091187
- September 14, 2010
- 05:55 AM
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Insetos assassinos
by Atila in Rainha Vermelha
Os insetos assassinos (assassin bugs) são membros da ordem dos percevejos (Hemiptera) com uma habilidade muito interessante. São predadores pacientes, que esperam as presas e sugam os fluídos delas através do canudão (nome científico do rostro), o aparelho bucal elongado que pode injetar uma saliva venenosa que paralisa e dissolve os tecidos de sua presa. Alguns são famosos por conta do veneno, e possuem ferroadas que podem doer bastante e deixar cicatrizes bem feias. O barbeiro é u........ Read more »
Weirauch, C., & Cassis, G. (2006) ATTRACTING ANTS: THE TRICHOME AND NOVEL GLANDULAR AREAS ON THE STERNUM OF PTILOCNEMUS LEMUR (HETEROPTERA: REDUVIIDAE: HOLOPTILINAE). Journal of the New York Entomological Society, 114(1 ), 28-37. DOI: 10.1664/0028-7199(2006)114[28:AATTAN]2.0.CO;2
Wignall, A., & Taylor, P. (2008) Biology and life history of the araneophagic assassin bug Stenolemus bituberus including a morphometric analysis of the instars (Heteroptera, Reduviidae). Journal of Natural History, 42(1), 59-76. DOI: 10.1080/00222930701825150
- September 6, 2010
- 06:28 AM
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Novos genes? Ok. Uma organela? Pra já. Como um vírus pode trazer novas funções
by Atila in Rainha Vermelha
A lesma-do-mar Elysia chlorotica é famosa por sua associação com cloroplastos roubados da algas que come. Muitas lesmas deste gênero são capazes de preservar os cloroplastos das algas das quais se alimentam e mantê-los em células especializadas que contiuam recebendo luz solar e fazendo fotossíntese, agora para a nova hospedeira. Um processo chamado de cleptoplastia, ou roubo de organela.
A Elysia chlorotica é especial em relação ao roubo de cloroplastos por ser capaz de mantê-lo........ Read more »
Rohwer F, & Thurber RV. (2009) Viruses manipulate the marine environment. Nature, 459(7244), 207-12. PMID: 19444207
- August 30, 2010
- 06:29 AM
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HIV, imunidade e a Rainha Vermelha
by Atila in Rainha Vermelha
E no episódio especial da corrida evolutiva Rainha Vermelha de hoje, por que uma de nossas proteínas do sistema imune não ataca o HIV.
Fonte: bored & extremely dangerous
Imunidade inata
Em 2004, testando os genes de macaco reso para descobrir qual deles impedia o HIV de se replicar nas células deste macaco, uma vez que ele consegue infectá-las mas seu ciclo é interrompido, um grupo de pesquisa americano encontrou a responsável por isso: a proteína TRIM5α. ........ Read more »
Kaiser SM, Malik HS, & Emerman M. (2007) Restriction of an extinct retrovirus by the human TRIM5alpha antiviral protein. Science (New York, N.Y.), 316(5832), 1756-8. PMID: 17588933
Johnson, W., & Sawyer, S. (2009) Molecular evolution of the antiretroviral TRIM5 gene. Immunogenetics, 61(3), 163-176. DOI: 10.1007/s00251-009-0358-y
- August 15, 2010
- 08:16 PM
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Beleza Viral
by Atila in Rainha Vermelha
Semper Augustus. Fonte: Wikimedia
Adoro quando consigo combinar biologia e arte, e hoje tenho um exemplo belíssimo. A aquarela de cima, de um artista holandês desconhecido, é da tulipa Semper Augustus. Durante a tulipomania, período entre 1634 e 1637 na Holanda em que os preços de tulipas subiram absurdamente, na primeira bolha econômica de que temos registro. As tulipas eram negociadas em mercados especiais, e variedades com cores "quebradas", diferentes padrões que variavam as cor........ Read more »
Garber, P. (1989) Tulipmania. Journal of Political Economy, 97(3), 535. DOI: 10.1086/261615
- August 2, 2010
- 09:58 PM
- 431 views
Vírus que causam câncer, vírus que curam câncer
by Atila in Rainha Vermelha
Um bom tema para mostrar como vírus não são apenas os Causadores de Doenças do Mal © que a maioria das pessoas conhece - e eu mesmo ajudei a reforçar, tratando quase exclusivamente de vírus como influenza e ebola aqui.Como eles causamTumores são células que perderam o controle sobre quando parar de se dividir. Corremos um risco constante disso acontecer quanto temos trilhões de entidades capazes de se reproduzir em nosso corpo. Temos também vários mecanismos que impedem os tumor........ Read more »
Lun X, Yang W, Alain T, Shi ZQ, Muzik H, Barrett JW, McFadden G, Bell J, Hamilton MG, Senger DL.... (2005) Myxoma virus is a novel oncolytic virus with significant antitumor activity against experimental human gliomas. Cancer research, 65(21), 9982-90. PMID: 16267023
- June 28, 2010
- 12:58 PM
- 421 views
Hepatite C e a rede social
by Atila in Rainha Vermelha
Como um vírus pode usar a rede social para ser transmitido em diferentes gerações. Se um vírus fosse transmitido por walkmans, você seria contaminado? ©WhineAndDine [Este post é baseado em um artigo publicado recentemente pelo meu laboratório. Felizmente, terei a oportunidade de explicá-lo e ainda mostrar como a informação de um artigo pode ser diluída conforme ele é tratado pela mídia no próximo post.] A Hepatite C é uma virose muito preocupante......... Read more »
Romano, C., de Carvalho-Mello, I., Jamal, L., de Melo, F., Iamarino, A., Motoki, M., Pinho, J., Holmes, E., Zanotto, P., & , . (2010) Social Networks Shape the Transmission Dynamics of Hepatitis C Virus. PLoS ONE, 5(6). DOI: 10.1371/journal.pone.0011170
- June 18, 2010
- 05:30 AM
- 426 views
Vírus da gripe suína muda em porcos na China
by Atila in Rainha Vermelha
©be_khe
Aproveitando que há um certo tempo não reclamo de uma notícia, vou combinar minha interpretação de um artigo recém publicado na Science e uma crítica à reportagem do iG (em itálico as partes que quero destacar):
Chineses apresentam nova genética da gripe suína
Pesquisadores identificaram mutações em oito genes do H1N1 que podem, eventualmente, contaminar seres humanos
[...]
Durante o monitoramento de porcos em um matad........ Read more »
Vijaykrishna, D., Poon, L., Zhu, H., Ma, S., Li, O., Cheung, C., Smith, G., Peiris, J., & Guan, Y. (2010) Reassortment of Pandemic H1N1/2009 Influenza A Virus in Swine. Science, 328(5985), 1529-1529. DOI: 10.1126/science.1189132
- May 28, 2010
- 04:04 AM
- 410 views
Temos de fato um Designer acima da evolução
by Atila in Rainha Vermelha
©Thea.trical •
Sim, meus caros. Durante estes longos dias de debate sobre Design Inteligente peregrinei pelo vasto terreno do PubMed. E após várias horas sem comer, sofrendo de delírios, um arbusto em chamas falou comigo um artigo me trouxe a luz. Encontrei o grande Criador. Sinceramente, encontrei vários artigos que mostram o que o DI defende, um Designer.
Ele, que é capaz de causar um evento de macroevolução diferenciando espécies que posteriormente sofrem microevoluçã........ Read more »
Suttle, C. (2005) Viruses in the sea. Nature, 437(7057), 356-361. DOI: 10.1038/nature04160
Sharon, I., Alperovitch, A., Rohwer, F., Haynes, M., Glaser, F., Atamna-Ismaeel, N., Pinter, R., Partensky, F., Koonin, E., Wolf, Y.... (2009) Photosystem I gene cassettes are present in marine virus genomes. Nature, 461(7261), 258-262. DOI: 10.1038/nature08284
La Scola, B., Desnues, C., Pagnier, I., Robert, C., Barrassi, L., Fournous, G., Merchat, M., Suzan-Monti, M., Forterre, P., Koonin, E.... (2008) The virophage as a unique parasite of the giant mimivirus. Nature, 455(7209), 100-104. DOI: 10.1038/nature07218
- May 6, 2010
- 10:47 PM
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Yes, nós temos complexo irredutível
by Atila in Rainha Vermelha
Sou obrigado a reconhecer que a biologia possui sim muita complexidade irredutível. ©Sergei Golyshev O criacionismo sempre foi uma crença baseada nas falhas da biologia. Por muito tempo, um dos principais argumentos que utilizavam para justificar um criador era a ausência de formas intermediárias. Como os seres humanos não foram criados por um ser maior, se não encontramos os passos que podem ter conduzido o caminho? Mas, conforme fomos estudando o meio natu........ Read more »
Yan, K., Fang, G., Bhardwaj, N., Alexander, R., & Gerstein, M. (2010) Comparing genomes to computer operating systems in terms of the topology and evolution of their regulatory control networks. Proceedings of the National Academy of Sciences. DOI: 10.1073/pnas.0914771107
- April 17, 2010
- 12:17 AM
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Vacina contra diarréia contaminada
by Atila in Rainha Vermelha
Vacinas são realmente puras, e se não são, quais os tipos de contaminantes? Circovírus suíno 1 em imagem de microscopia. Fonte. Existem dois tipos principais de vacina: a inativada, que é feita de pedaços do patógeno (vírus ou bactéria que queremos combater) que não são capazes de causar infecção, como a vacina da gripe (tanto sazonal quanto do último H1N1); e a atenuada, que é feita cultivando o patógeno em um outro animal e selecionando variantes que quase não causam sintoma........ Read more »
Victoria, J., Wang, C., Jones, M., Jaing, C., McLoughlin, K., Gardner, S., & Delwart, E. (2010) Viral nucleic acids in live-attenuated vaccines: detection of minority variants and an adventitious virus. Journal of Virology. DOI: 10.1128/JVI.02690-09
- February 24, 2010
- 11:31 PM
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Remédio para tudo: um antiviral que ataca diversos vírus
by Atila in Rainha Vermelha
Quando vocë vai ao médico com a garganta infeccionada, ele pode
tranquilamente receitar antibióticos sem precisar tipar a bactéria em
sua garganta, pois alguns antibióticos agem em vários micróbios diferentes.
Porque não temos a mesma coisa para os vírus?
Ribossomo bacteriano em azul, com o antibiótico neomicina em vermelho, impedindo que o fator de reciclagem ribossômica (amarelo) libere o ribossomo para continuar a fazer proteínas. Fonte: Structural Genomics Knowledgebase.Por ........ Read more »
De Clercq, E. (2002) STRATEGIES IN THE DESIGN OF ANTIVIRAL DRUGS. Nature Reviews Drug Discovery, 1(1), 13-25. DOI: 10.1038/nrd703
Wolf, M., Freiberg, A., Zhang, T., Akyol-Ataman, Z., Grock, A., Hong, P., Li, J., Watson, N., Fang, A., Aguilar, H.... (2010) A broad-spectrum antiviral targeting entry of enveloped viruses. Proceedings of the National Academy of Sciences, 107(7), 3157-3162. DOI: 10.1073/pnas.0909587107
- February 19, 2010
- 07:47 PM
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Um fungo faz o que um engenheiro faz
by Atila in Rainha Vermelha
Já reparou que, para a maioria das máquinas que construímos, bastam uma ou duas peças fora do lugar ou condições de funcionamento um pouco fora do padrão e já era? Organismos, em compensação, costumam ser muito mais robustos e tolerantes a erros e adversidades. Mude o meio de uma bactéria, sua temperatura e arranque alguma proteína aleatória de seu DNA e são grandes as chances de ela continuar viva.Physarum, o engenheiro do dia. ©chickeninthewoodsEsta diferença acontece por vári........ Read more »
Tero, A., Takagi, S., Saigusa, T., Ito, K., Bebber, D., Fricker, M., Yumiki, K., Kobayashi, R., & Nakagaki, T. (2010) Rules for Biologically Inspired Adaptive Network Design. Science, 327(5964), 439-442. DOI: 10.1126/science.1177894
- February 4, 2010
- 08:14 PM
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Passando a bola: como vírus se ajudam a ir além
by Atila in Rainha Vermelha
Formação de placa é um dos ensaios mais antigos que se faz em virologia. Trata-se de cultivar uma camada única de células, sejam elas de origem animal ou bactérias, e despejar sobre elas partículas virais diluídas o suficiente para que apenas uma delas consiga infectar uma célula e de lá se propagar, formando uma placa ou halo de células mortas para trás. Como as que não estão mais coloridas de azul abaixo. É útil para uma série de experimentos como medir a eficiência de um ví........ Read more »
Doceul, V., Hollinshead, M., van der Linden, L., & Smith, G. (2010) Repulsion of Superinfecting Virions: A Mechanism for Rapid Virus Spread. Science. DOI: 10.1126/science.1183173
- January 12, 2010
- 07:33 PM
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Pulgões e interações, uma história em 4 FUUUs
by Atila in Rainha Vermelha
Uma das coisas que mais gosto na biologia é sua riqueza de detalhes. A cada esquina há uma interação nova e inesperada. Pegue um pulgão, por exemplo:Fonte: WikimediaNada mais simples do que um pulgão sugando a seiva de uma planta. Ele insere seu estilete nos vasos da planta e suga a seiva dela. Mas há uma guerra química por baixo disso, e ambos são agredidos. A planta defende-se do pulgão liberando substâncias tóxicas como oxigênio reativo, além de sinalizar para que as células do........ Read more »
Kessler, A., & Baldwin, I. (2002) PLANT RESPONSES TO INSECT HERBIVORY: The Emerging Molecular Analysis. Annual Review of Plant Biology, 53(1), 299-328. DOI: 10.1146/annurev.arplant.53.100301.135207
WOOL, D. (2005) Differential colonization of host trees by galling aphids: Selection of hosts or selection by hosts?. Basic and Applied Ecology, 6(5), 445-451. DOI: 10.1016/j.baae.2005.07.007
Oliver TH, Leather SR, & Cook JM. (2008) Macroevolutionary patterns in the origin of mutualisms involving ants. Journal of evolutionary biology, 21(6), 1597-608. PMID: 18764883
Oliver KM, Degnan PH, Hunter MS, & Moran NA. (2009) Bacteriophages encode factors required for protection in a symbiotic mutualism. Science (New York, N.Y.), 325(5943), 992-4. PMID: 19696350
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