Efrain De Luna

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  • December 5, 2009
  • 02:00 PM
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Filogenética bajo Verosimilitud con un enfoque para "PhDs"

by Efrain De Luna in Noticias sobre Filogenetica

A cuantos de nosotros el Profesor del curso de Filogenética nos obligó a calcular la longitud (parsimonia) y/o verosimilitud de un árbol, "a mano"?
Se ha anunciado la disponibilidad de un paquete de programas integrados para filogenia en un articulo recién publicado en PlosONE: Shu-Hwa Chen et al. 2009. PALM: A Paralleled and Integrated Framework for Phylogenetic Inference with Automatic Likelihood Model Selectors. ... Read more »

  • May 20, 2009
  • 01:53 PM
  • 1,302 views

Secuencias “COI-like numts” inutilizan los codigos de barras de DNA

by Efrain De Luna in Noticias sobre Filogenetica

BioOne Online Journals - “COI-like” Sequences are Becoming Problematic in Molecular Systematic and DNA Barcoding Studies"La exploración de la biodiversidad, la clasificación filogenética y la identificación de muestras son las tres tareas fundamentales de la sistemática. Los obstáculos y dificultades en cada área son diversos, pero como biólogos todos sabemos lo difícil que es identificar taxonómicamente una c........ Read more »

  • May 12, 2009
  • 09:12 PM
  • 1,478 views

Considerable diversidad genética entre mexicanos

by Efrain De Luna in Noticias sobre Filogenetica

Los proyectos del Genoma Humano ciertamente han detectado diferencias genéticas entre grupos como los europeos (Caucásicos), asiáticos (China, Japón) y africanos (Yoruba). Pero ahora resulta que un analisis de la diversidad genomica total reveló también considerables diferencias entre varias poblaciones de mexicanos.La población mexicana actual resulta ser un mosaico de diferentes grupos genéticos. El gradiente va desde poblaciones con un genoma mayormente zapoteca (el único grupo indí........ Read more »

Silva-Zolezzi, I., Hidalgo-Miranda, A., Estrada-Gil, J., Fernandez-Lopez, J., Uribe-Figueroa, L., Contreras, A., Balam-Ortiz, E., Bosque-Plata, L., Velazquez-Fernandez, D., Lara, C.... (2009) Analysis of genomic diversity in Mexican Mestizo populations to develop genomic medicine in Mexico. Proceedings of the National Academy of Sciences. DOI: 10.1073/pnas.0903045106  

  • April 30, 2009
  • 03:43 PM
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Cladistics: Analisis de una matriz gigante de 73000 UT

by Efrain De Luna in Noticias sobre Filogenetica

Esto si que es difícil de creer: el análisis cladístico de una matriz "super gigante" de 73060 entidades. Así es, no es error de dedo, más de 73 mil unidades terminales! Este análisis portentoso fue efectuado por un equipo basado en Tucumán (Argentina) liderado por Pablo Goloboff. La referencia del artículo, por ahora solo disponible en linea, es:Phylogenetic analysis of 73 060 taxa corroborates major eukaryotic groupsPablo A. Go........ Read more »

Goloboff, P., Catalano, S., Marcos Mirande, J., Szumik, C., Salvador Arias, J., Källersjö, M., & Farris, J. (2009) Phylogenetic analysis of 73 060 taxa corroborates major eukaryotic groups. Cladistics. DOI: 10.1111/j.1096-0031.2009.00255.x  

  • February 18, 2009
  • 11:53 AM
  • 1,212 views

Que son los Analisis de Componentes Principales "Evolutivos"?

by Efrain De Luna in Morfometria Geometrica

Confieso mi ingenuidad e ignorancia: me ha sorprendido leer que existen "Análisis de Componentes Principales Evolutivos"!La fuente de la iluminación es el articulo:Jesse M Meik & Andre Pires-daSilva. 2009. Evolutionary morphology of the rattlesnake style. BMC Evolutionary Biology 9:35 doi:10.1186/1471-2148-9-35 Article URL http://www.biomedcentral.com/1471-2148/9/35Así que me dispuse a leerlo y averiguar que es este método, pues solo con el nombre me inspira una predisposición psicológica ........ Read more »

Meik, J., & Pires-daSilva, A. (2009) Evolutionary morphology of the rattlesnake style. BMC Evolutionary Biology, 9(1), 35. DOI: 10.1186/1471-2148-9-35  

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